Dann probiers mal mit Degraded zu öffnen ich glaube dort zeigt er dir auch Bad Blocks etc. an bin mir zwar nicht ganz sicher ob das auch 256mb nand's unterstützt aber probiers einfach mal aus. Das neueste ist glaube ich Degraded 1.1b.
Die 2 Files von denen du redest werden doch von nandchecker erstellt wenn man damit ein Nand-dump öffnet wenn ich das jetzt richtig verstehe... Kann es sein das du eventuell probiert hast das 256 Mb Nand mit dem Nandchecker zu öffnen und da das nicht funktioniert (da der Nandchecker eben keine 256 mb dumps unterstützt) sind die beiden zusätzlichen Dateien leer?!
Also ist jetzt nur ne Vermutung aber beim ganz normalen auslesen des Nands solltest du eigentlich nur eine Datei haben.